2020年2月,肝癌藥物基因組學(xué)“藍(lán)圖”,通過(guò)《基因組蛋白質(zhì)組與生物信息學(xué)報(bào)》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 簡(jiǎn)稱(chēng)GPB)組織的領(lǐng)域同行專(zhuān)家評(píng)審,成功入選2019年度“中國(guó)生物信息學(xué)十大應(yīng)用”。該工作是由中國(guó)科學(xué)院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所惠利健團(tuán)隊(duì)、中國(guó)科學(xué)院上海營(yíng)養(yǎng)與健康研究所李亦學(xué)團(tuán)隊(duì)、中國(guó)人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)張海斌團(tuán)隊(duì)和南京大學(xué)附屬鼓樓醫(yī)院施曉雷合作完成,于2019年8月在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Cell旗下子刊Cancer Cell上發(fā)表的研究成果。該成果構(gòu)建了目前最大的肝癌細(xì)胞模型平臺(tái),包括50株新建立的中國(guó)病人來(lái)源的肝癌細(xì)胞系和31株發(fā)表的肝癌細(xì)胞系,重現(xiàn)了肝癌患者的基因組和轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性。通過(guò)整合大規(guī)模測(cè)序和高通量藥物篩選數(shù)據(jù),研究人員建立了肝癌中基因組變異與藥物響應(yīng)的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)了新的治療靶點(diǎn)和分子標(biāo)志物,為索拉菲尼的個(gè)體化治療提供了循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。
文章鏈接:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2019.07.001
2019年度“中國(guó)生物信息學(xué)十大應(yīng)用”公布:http://gpb.big.ac.cn/news/1009
