12月2日至6日，在中科院上海分院系統(tǒng)專業(yè)技術(shù)短期培訓(xùn)項(xiàng)目的指導(dǎo)與資助下，上海營養(yǎng)與健康研究所生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心攜手上海市生物信息學(xué)會(huì)在滬舉辦了為期五天的“大數(shù)據(jù)時(shí)代的全基因組關(guān)聯(lián)分析：從基因組到表型組的多組學(xué)研究新技術(shù)”培訓(xùn)班。來自于中科院系統(tǒng)內(nèi)研究所、復(fù)旦大學(xué)、上海交通大學(xué)、北京大學(xué)、浙江大學(xué)、澳門大學(xué)等91個(gè)單位的356位科研人員及在讀研究生參加了培訓(xùn)。培訓(xùn)班由生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心青年研究員黃濤主持，生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心首席科學(xué)家趙國屏院士和研究所學(xué)術(shù)所長李林院士分別為學(xué)員帶來了開場(chǎng)主旨報(bào)告和培訓(xùn)班結(jié)班總結(jié)。
12月2日，汪思佳副所長代表所領(lǐng)導(dǎo)班子做了開班動(dòng)員，對(duì)廣大學(xué)員提出了三點(diǎn)希望，一是希望大家能常學(xué)常新，二是希望大家注重專業(yè)技術(shù)的培養(yǎng)，三是希望大家深入理解數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)型建制化研究。隨后，趙國屏院士做了開場(chǎng)主旨報(bào)告《“大數(shù)據(jù)”時(shí)代為“小科學(xué)”服務(wù)的生物信息學(xué)——背景、思考和建議》，解讀了諾貝爾獎(jiǎng)獲得者Renato Dulbecco于1986年在Science上發(fā)表的人類基因組測(cè)序短文，指出了人類基因組計(jì)劃的劃時(shí)代意義，回顧了2001年遺傳性乳光牙本質(zhì)致病基因DSPP和2002年遺傳性兒童白內(nèi)障致病基因HSF4的發(fā)現(xiàn)歷程，總結(jié)了2003年SARS分子流行病學(xué)和病毒進(jìn)化研究的經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)。12月4日，生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心主任李亦學(xué)研究員在線以《科學(xué)大數(shù)據(jù)分析在健康領(lǐng)域中的應(yīng)用——數(shù)據(jù)密集型科學(xué)研究的新范式對(duì)生物信息學(xué)的新要求》為題向培訓(xùn)學(xué)員作了專題報(bào)告，報(bào)告內(nèi)容緊扣科研熱點(diǎn)，展示了由大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)結(jié)合人工智能手段在新冠病毒演化預(yù)測(cè)預(yù)警工作中發(fā)揮的作用。12月6日，營養(yǎng)與健康所學(xué)術(shù)所長李林院士做了結(jié)班總結(jié)致辭，祝賀培訓(xùn)圓滿結(jié)束，同時(shí)對(duì)今后的培訓(xùn)工作提出了要求，希望能夠干濕結(jié)合，吸引更多實(shí)驗(yàn)科研人員加入，形成品牌效應(yīng)，越辦越好。
為了滿足廣大學(xué)員的熱切愿望，培訓(xùn)在線下和線上同步開展。秉持開放合作的原則，除了來自營養(yǎng)與健康所的17位報(bào)告人，培訓(xùn)班還邀請(qǐng)了來自復(fù)旦大學(xué)、上海交通大學(xué)、廣州實(shí)驗(yàn)室、英國諾和諾德牛津研究中心、美國明尼蘇達(dá)大學(xué)等15家國內(nèi)外單位的23位報(bào)告人。講課內(nèi)容包括全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）、表觀基因組關(guān)聯(lián)分析（EWAS）、UK Biobank人群大隊(duì)列分析、國際人類表型組計(jì)劃、自然人群遺傳多樣性、泛基因組分析、孟德爾隨機(jī)化分析、基因組結(jié)構(gòu)變異、染色體構(gòu)象分析、DNA甲基化、RNA甲基化、eQTL/mQTL調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、知識(shí)圖譜、癌癥多組學(xué)整合分析、單細(xì)胞多組學(xué)、深度學(xué)習(xí)和生物醫(yī)學(xué)人工智能等。報(bào)告主題涉獵廣泛，與學(xué)員的日常科研息息相關(guān)，課堂分享的內(nèi)容實(shí)用性很強(qiáng)。
本次培訓(xùn)班增進(jìn)了學(xué)員對(duì)營養(yǎng)與健康所生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)資源（組學(xué)數(shù)據(jù)百科全書NODE）和在線數(shù)據(jù)分析工具（精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)可視化集成分析平臺(tái)VIPMAP和微生物集成分析云平臺(tái)iMAC）的了解，宣傳了生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心和所內(nèi)外課題組合作開發(fā)的組學(xué)數(shù)據(jù)平臺(tái)（PGG.MHC，PGG.SV，PGG.Han 2.0和dbDEMC 3.0），58名學(xué)員在線填寫了數(shù)據(jù)服務(wù)需求調(diào)研問卷，真實(shí)反饋了科研工作中數(shù)據(jù)處理環(huán)節(jié)的“堵點(diǎn)、痛點(diǎn)、難點(diǎn)”，有助于生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心構(gòu)建用戶畫像，促進(jìn)生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)中心在數(shù)據(jù)資源體系建設(shè)、數(shù)據(jù)分析服務(wù)方面提供更高水平的服務(wù)。
官方微信
