8月27日下午,中國科學院上海營養與健康研究所所級科學數據中心舉辦了“生物醫學知識圖譜構建技術”培訓,旨在幫助科研人員了解和掌握生物醫學知識圖譜構建技術。本次培訓由中心高級工程師凌鋆超擔任主講人,其研究方向為生命組學數據庫/知識庫建設與生物信息學分析,目前主要負責健康醫療和生物醫學數據庫研發方向的架構設計與研發,成果包括中國人群動態基因組數據庫、NODE國家組學數據百科全書、PGG.SV結構變異數據庫在內的多項生命科學數據庫資源,作為項目骨干還參與了多項國家重點研發計劃等并積累了豐富的經驗,曾在Nucleic Acids Research、Science Bulletin、Bioinformatics等期刊發表多篇基因組學和數據庫相關文章。
凌鋆超首先介紹了數據庫、知識庫和知識圖譜的概念及區別。隨后,他分析了常見的知識圖譜類型、知識圖譜的典型應用、構建的關鍵技術、構建的必要性、構建問題以及知識表示框架等內容。此外,他還詳細介紹了中心已經構建的精準藥物知識圖譜CPMKG、結核分枝桿菌免疫原知識圖譜、以及基于自然語言垂直大模型的知識圖譜的背景、建設流程及應用,著重介紹了基于大模型的結核抗原知識圖譜。最后,他從數據、大模型和下游任務三個方面對知識圖譜進行了總結,并展望了未來的發展方向。
培訓過程中,學員們積極參與,踴躍發言,并與主講人進行了深入交流和討論,更深入地學習了所級科學數據中心基于大模型和知識模式驅動的條件知識圖譜方面的工作,進一步了解到中心可以提供的數據庫和工具軟件開發服務,為科學研究提供了有力支持。
營養與健康所所級科學數據中心將持續舉辦相關主題的培訓活動,以幫助更多科研人員了解中心提供的保全、保供、增值、定制等四類服務。同時,所級科學數據中心還設計了相關調研問卷(詳見文末二維碼),誠邀科研人員提出寶貴意見和建議,以便進一步優化和提升服務質量。通過與科研人員的積極互動和反饋,中心將不斷改進服務流程,提升技術支持質量,為進一步滿足科研需求提供更加優質的服務。

凌鋆超高級工程師作培訓報告
