2019年7月3日,國際著名學術期刊Cell Stem Cell在線發表了題為“A Homeostatic Arid1a-Dependent Permissive Chromatin State Licenses Hepatocyte Responsiveness to Liver-Injury-Associated YAP Signaling”的研究論文。該研究由中國科學院分子細胞科學卓越創新中心惠利健研究組與中國科學院上海營養與健康研究所李亦學研究組合作完成。該研究發現染色體重塑調控蛋白Arid1a介導肝細胞重編程基因在正常的肝細胞中預打開,使肝細胞具有響應損傷誘導的YAP信號而轉錄激活重編程基因的潛能,揭示了肝細胞去分化可塑性的分子基礎。
李亦學研究組長期從事組學大數據相關的算法開發和數據挖掘,并將其應用于腫瘤等復雜疾病的研究。在這項最新的研究進展中,研究團隊通過構建肝細胞中Arid1a敲除的缺陷小鼠,發現Arid1a缺失會抑制肝臟損傷修復。鑒于Arid1a作為染色質重塑復合體的重要組分,科研人員通過ATAC-seq技術研究染色質開放區域。發現在肝臟正常狀態時,Arid1a通過賦予肝細胞重編程基因染色質預打開的狀態,幫助肝細胞能夠快速應對損傷信號,避免劇烈的染色質重塑。同時結合ChIP-seq和RNA-seq,科研人員識別了轉錄因子Yap響應Arid1a介導的肝細胞重編程過程,Yap與肝細胞重編程基因結合,轉錄激活肝細胞重編程基因的表達,使肝細胞具有響應Hippo/Yap信號通路的分子基礎。
中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生化與細胞研究所)李維平博士、博士研究生何強和中國科學院上海營養與健康研究所楊力光博士為該論文共同第一作者,分子細胞中心惠利健研究員,營養與健康研究所李亦學研究員、李虹副研究員為共同通訊作者。該工作得到第二軍醫大學附屬長征醫院謝渭芬課題組的大力支持,并獲中科院、基金委、科技部、上海市科委等資助。
文章鏈接:https://www.cell.com/cell-stem-cell/fulltext/S1934-5909(19)30272-3

圖:Ardi1a調控損傷誘導的肝細胞重編程機制