6月30日,國際學(xué)術(shù)期刊Arthritis & Rheumatology在線發(fā)表了中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所尹慧勇研究組題為“Metabolomics and Machine Learning Identify Metabolic Differences and Potential Biomarkers for Frequent versus Infrequent Gout Flares”的最新研究成果,揭示了頻發(fā)與偶發(fā)型痛風(fēng)患者的血清代謝圖譜,并建立了痛風(fēng)頻繁發(fā)作的預(yù)警模型。
痛風(fēng)是一種常見的炎癥性關(guān)節(jié)疾病,其病因主要是由尿酸代謝異常、尿酸鹽晶體沉積在關(guān)節(jié)或關(guān)節(jié)周圍組織中引起的急性炎癥反應(yīng)。隨著中國經(jīng)濟的不斷發(fā)展,人們生活方式和飲食結(jié)構(gòu)的改變,痛風(fēng)的發(fā)病率在過去的幾十年里持續(xù)增加。根據(jù)中華醫(yī)學(xué)會內(nèi)分泌分會制定的《2019中國高尿酸血癥與痛風(fēng)診療指南》,中國大陸成人高尿酸血癥發(fā)病率13.3%,痛風(fēng)為1.1%,已經(jīng)成為繼糖尿病之后的又一常見代謝性疾病。越來越多的證據(jù)表明,痛風(fēng)與高血壓、糖尿病、肥胖癥、心腦血管疾病和慢性腎臟疾病等密切相關(guān)。
痛風(fēng)的發(fā)作通常持續(xù)7至14天,并自行消退,然后進入無癥狀間歇期,直到下一次發(fā)作。無癥狀間歇期的持續(xù)時間在患者中個體差異很大,部分患者持續(xù)1到2年,而部分患者只持續(xù)幾個月。2016年歐洲風(fēng)濕病聯(lián)盟(European Alliance of Associations for Rheumatology, EULAR)和2020年美國風(fēng)濕病協(xié)會(American College of Rheumatology, ACR)發(fā)布的痛風(fēng)管理臨床指南中,對每年痛風(fēng)發(fā)作次數(shù)≤1次的患者臨床診斷為偶發(fā)型痛風(fēng)(Infrequent Gout Flares, InGF),每年痛風(fēng)發(fā)作次數(shù)≥2次的患者,為頻發(fā)型痛風(fēng) (Frequent Gout Flares, FrGF)。指南建議針對頻發(fā)與偶發(fā)患者應(yīng)采取不同的臨床治療策略,特別是降尿酸藥物的使用以及尿酸的目標值。然而,由于目前臨床上缺乏對痛風(fēng)發(fā)作頻率的早期預(yù)測,現(xiàn)在歐美和我國的痛風(fēng)臨床實踐中對于頻發(fā)和偶發(fā)患者的診斷只能基于患者已經(jīng)發(fā)病的頻率。如果僅憑臨床經(jīng)驗對痛風(fēng)頻發(fā)與偶發(fā)患者采取指南的建議,可能會導(dǎo)致部分患者,特別是首次診斷的患者治療不足或過度。因此,建立痛風(fēng)頻發(fā)與偶發(fā)的早期風(fēng)險預(yù)測,可以及時準確地根據(jù)不同痛風(fēng)患者的發(fā)病機制,實現(xiàn)痛風(fēng)患者的精準治療,具有十分重要的臨床意義。
代謝組學(xué)是一種定性與定量分析特定生物系統(tǒng)中所有代謝物的組學(xué)技術(shù),可以在系統(tǒng)生物學(xué)層面研究代謝通路失調(diào),已逐漸成為研究代謝性疾病必備的研究工具。尹慧勇研究組長期聚焦代謝組學(xué)技術(shù)前沿技術(shù)研發(fā),與青島大學(xué)附屬醫(yī)院的李長貴教授團隊長期合作,在科技部精準學(xué)項目資助下研究高尿酸與痛風(fēng)的精準醫(yī)學(xué)策略。前期已利用代謝組學(xué)技術(shù)結(jié)合機器學(xué)習(xí)系統(tǒng)性揭示了痛風(fēng)與高尿酸患者代謝差異,并首次建立了高尿酸發(fā)展為痛風(fēng)的風(fēng)險預(yù)測模型(Shen et al, Arthritis & Rheumatology, 2021)。
在本研究中,研究人員利用兩個獨立痛風(fēng)病人臨床隊列,在發(fā)現(xiàn)集隊列中納入了163例偶發(fā)與239例頻發(fā)型痛風(fēng)患者,收集血清并進行非靶向代謝組學(xué)分析。通過通路富集和代謝網(wǎng)絡(luò)分析,首次發(fā)現(xiàn)了嘌呤代謝、咖啡因代謝、氨基酸代謝等通路的紊亂和其中的相互作用可能與痛風(fēng)的發(fā)作頻率相關(guān)。利用機器學(xué)習(xí)算法,研究人員在非靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)中篩選出了25種預(yù)測能力強、可信度高、定量穩(wěn)定性高的代謝物作為生物標志物,建立并優(yōu)化精確定量的靶向代謝組學(xué)方法。在獨立的驗證集隊列中納入97偶發(fā)和139例頻發(fā)痛風(fēng)患者。最終,基于靶向代謝組學(xué)數(shù)據(jù)中的六種代謝物作為生物標志物建立預(yù)測模型,該模型在發(fā)現(xiàn)集和驗證集中AUROC分別達到0.88和0.67。該研究為臨床上頻發(fā)與偶發(fā)痛風(fēng)患者的治療策略提供了理論基礎(chǔ),也為痛風(fēng)頻繁發(fā)作提供了預(yù)測模型。

圖注: 利用代謝組學(xué)與機器學(xué)習(xí)研究頻發(fā)與偶發(fā)痛風(fēng)患者的血清代謝組差異并研發(fā)痛風(fēng)頻發(fā)風(fēng)險預(yù)測模型
中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所尹慧勇研究員與青島大學(xué)附屬醫(yī)院李長貴教授為該論文共同通訊作者,青島大學(xué)附屬醫(yī)院的博士研究生王明和上海科技大學(xué)與中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所聯(lián)合培養(yǎng)博士李銳為該論文共同第一作者。該研究得到科技部國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金等的經(jīng)費支持,上海營養(yǎng)與健康研究所公共技術(shù)平臺為研究工作提供了技術(shù)支撐,還得到了美國加州大學(xué)圣地亞哥分校Robert Terkeltaub教授(國際晶體性疾病研究聯(lián)盟主席)、新西蘭奧克蘭大學(xué)Nicola Dalbeth教授、美國阿拉巴大學(xué)伯明翰分校Tony Merriman教授的大力支持。相關(guān)研究工作也已經(jīng)申請中國和國際專利。